افشین در این نامه نوشته است: «طی ماه‌های اخیر به ویژه در جریان گفت‌وگوهای میدانی با فعالان زیست بوم فناوری از جمله سفرهای استانی و به خصوص در سفر اخیر اینجانب به استان کرمانشاه، مجموعه‌ای از نارضایتی‌های متراکم و گزارش‌های هم راستا از ناکارآمدی ساختاری در آن معاونت به دست رسید که حکایت از بی ثباتی در تصمیم‌گیری، پرداختن به موضوعات فرعی و بی ارتباط با مسیر واقعی توسعه اقتصاد دانش بنیان و فاصله گرفتن از روحیه عمل‌گرایانه در حکمرانی داشت.

انباشت طرح‌های معطل مانده که اغلب آنان را شخصاً از معطل بودن نجات دادم، غفلت از ماموریت‌های اساسی و فقدان تمرکز بر ظرفیت‌های بالفعل و بالقوه زیست بوم فناوری کشور شواهدی است که متاسفانه نه با تذکر اصلاح شد و نه با گذشت زمان تعدیل گردید و اینک پیامد آن عدم رضایت طیف وسیعی از نخبگان و کار آفرینان این حوزه است.»

غفلت از مأموریت‌های اساسی و فقدان تمرکز بر ظرفیت‌های فناوری کشور از دیگر مواردی بوده که به گفته افشین، با تذکرات مکرر نیز اصلاح نشده و این وضعیت به عدم رضایت نخبگان و کارآفرینان منجر شده است.»